原作故事主要讲述了在大都市出生长大的书道家男主半田清舟因为对馆长大打出手被父亲流放至偏远的五岛上修行,并要求他找回自己“欠缺的人类应有的部分”。在充满自然景观的岛上,他遇到了天真少女琴石奈留和诸多岛民,并逐渐学会了人情温暖的日常。故事发生在一片名为“云荒”的奇幻大陆上,以时影、朱颜为代表的空桑人族,和与止渊为首的鲛族及冰族十巫世居于此。剧集所构建的云荒大陆奇幻世界体系,承袭了《山海经》之中所描述的幻想世界。故事一开篇就进展迅速,身为太子的时影被宠妃陷害,其白族母后为保住时影的性命上演了一出假死的戏码,时影实则被九嶷山大司命所救,逃入九嶷山修炼并等待时机重回王朝。